Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX9Q9NQ69 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms