Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLMPQ9H6B4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms