Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF6Q9BYE7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms