Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms