Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHCHD6Q9BRQ6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms