Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TUBA1CQ9BQE3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA1CQ9BQE3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms