Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VAT1Q99536 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms