Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms