Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF4BQ92750 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms