Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LRTOMTQ8WZ04 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRTOMTQ8WZ04 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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