Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC112Q8NEF3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC112Q8NEF3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms