Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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RAB11FIP4Q86YS3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB11FIP4Q86YS3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB11FIP4Q86YS3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB11FIP4Q86YS3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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RAB11FIP4Q86YS3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB11FIP4Q86YS3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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RAB11FIP4Q86YS3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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