Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCBE1Q6UXH8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms