Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBLN3Q6UW01 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms