Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT80Q6KB66 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT80Q6KB66 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms