Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM69BQ5VUD6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms