Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms