Protein–RNA interactions for Protein: Q16829

DUSP7, Dual specificity protein phosphatase 7, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP7Q16829 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP7Q16829 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms