Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPROQ16827 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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