Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A3Q16572 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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