Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMD5Q16401 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms