Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
ZNF56Q15929 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms