Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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NEDD8Q15843 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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NEDD8Q15843 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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NEDD8Q15843 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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NEDD8Q15843 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8Q15843 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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