Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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SS18Q15532 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SS18Q15532 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SS18Q15532 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SS18Q15532 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SS18Q15532 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SS18Q15532 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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SS18Q15532 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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SS18Q15532 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SS18Q15532 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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