Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAPTM4AQ15012 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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