Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB39AQ14964 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms