Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTTNQ14247 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTTNQ14247 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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