Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PMS2P3Q13401 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PMS2P3Q13401 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PMS2P3Q13401 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PMS2P3Q13401 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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