Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms