Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NFIAQ12857 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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