Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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