Protein–RNA interactions for Protein: Q12756

KIF1A, Kinesin-like protein KIF1A, humanhuman

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1AQ12756 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIF1AQ12756 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms