Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PAX8Q06710 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms