Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNB3Q05901 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms