Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CYP27A1Q02318 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms