Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XPCQ01831 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XPCQ01831 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XPCQ01831 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
XPCQ01831 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XPCQ01831 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms