Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK16Q00536 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK16Q00536 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms