Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VLDLRP98155 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VLDLRP98155 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms