Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPNP63162 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms