Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms