Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLDN2P57739 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms