Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2BFSP57053 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2BFSP57053 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms