Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PLTPP55058 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PLTPP55058 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PLTPP55058 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLTPP55058 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLTPP55058 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PLTPP55058 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLTPP55058 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLTPP55058 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLTPP55058 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLTPP55058 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PLTPP55058 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms