Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAD23AP54725 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAD23AP54725 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms