Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A3P48764 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC9A3P48764 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms