Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT6CP48668 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms