Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP2K4P45985 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MAP2K4P45985 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms