Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSFMP43897 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSFMP43897 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms