Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA5P31644 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GABRA5P31644 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GABRA5P31644 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GABRA5P31644 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms