Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2E2P29084 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms